Okulumuz 1968–1969 öğretim yılında Çobanlar Orta Okulu olarak öğretime açılmıştır. 1987/1988 öğretim yılında bu günkü binasında ortaokula dayalı olarak Çobanlar Lisesi’ne, 1996/1997 öğretim yılında Çobanlar Çok Programlı Lise’ye dönüştürülmüştür. Halen genel lise, imam hatip lisesi, muhasebe ve finansman ile bilişim teknolojileri bölümleri ile öğretim faaliyetlerine devam etmektedir. Okulun binası 03.02.2002 tarihinde meydana gelen depremde orta hasar görmüş olup 18.02.2002 tarihinde eğitim öğretime kapatılmıştır. 2002-2007 yılları arasında eğitim-öğretim faaliyetleri Çobanlar Zafer İlköğretim Okulu’nda sürdürülmüştür. 2007/2008 eğitim öğretim yılının başlamasıyla birlikte yeni hizmet binasının kullanımına başlanmıştır.